Pogodan "kandidat gena" i meta-analize u identifikaciji alela rizika

U posljednjih 15 godina došlo je eksponencijalni rast u broju studija o identifikaciji gena za nastanak koronarne bolesti srca. Međutim, nedostatak obnovljivosti podataka o alela gena i njihov odnos s rizikom od KBS krmača sumnje među epidemiološke genetike. Većina njih još uvijek se odnosi na istraživanje bilo koji pojedinačni jednoj bazi zamjene, što može biti jednostavan polimorfizam i ne znači ništa. Trenutno, takve studije su svedeni na tzv meta-analize, analizirajući određene supstitucije nukleotida u mnogim populacijama. U posljednjih nekoliko godina, objavio nekoliko meta-analiza (tabela. 1).

Tabela 1

Liste varijante gena sa objavljenim rezultatima meta-analiza na rizik od srčanih bolesti. U nekoliko izvode testovi na istoj gen varijanta pokazuje samo pozivanje na poslednji

gen (Varijante)	genotip, povezane sa rizikom	Broj studija (broj predmeta)	Učinak (95% CI)	link
AT1R (1166A >C)	C +	27 (10.180)	1,13 (1,04- 1,23)	Ntzani et al., 2007
MMRZ (5A / 6A)	5A +	8 (3655)	1,26 (1,11- 1,4)	Abilleira et al., 2006
MMP9 (1562S >T)	T +	5 (4817)	1.11 (1- 1.3)	Abilleira et al., 2006
ApoE &epsilon-2, 3, 4	2+ 4+	121 (37.850)	0,8 (0,70- 0,90) 1,06 (0,99- 1,13)	Bennet et al., 2007
LTA (10G >A)	A +	7 (10.996)	1,09 (1,02- 1,16)	Clarke i dr., 2006
LPL (N291S)	S +	21 (1203)	1,48 (1,09- 2)	Hu et al., 2006
AGT (T174M) (M235T)	M + T +	43 (13478)	1,07 (0,93- 1,22) 1,11 (1,03- 1,19)	Xu et al .. 2007
F5 (1691G >A) F7 (10976G >A) F2 (20210G >A) PAI1 (4G / 5G) GP1A (807C >T) GP1BA (5T >C) GP3A (1565 C >T)	A + A + A + 5G + T + C + T +	60 (15.704) 24 (7444) 40 (11,625) 37 (11,763) 15 (6414) 14 (6652) 43 (16.984)	1,17 (1,08-1,28) 0,97 (0,91-1,04) 1,31 (1,12-1,52) 1,06 (1,02-1,1) 1,02 (0,97-1,08) 1,05 (0,96-1,13) 1,03 (0,98-1,07)	Ye et al., 2006
IL-6 (174g >C)	C +	8 (4799)	1,12 (0,97- 1,29)	Sie et al., 2006
F13 (V34L)	L +	12 (8743)	0,79 (0,66- 0,93)	Shafey et al., 2007

Jedan od najviše proučavanih gena koji kodiraju plazma apolipoproteina E, koji se zove ApoE. Najčešći ApoE-alela - E3. Tu su i dva druge opcije - E4 i E2 (prevalencija ovih alela među ljudima u Evropi je 0.15 i 0.07, respektivno). Promjene u DNK sekvence gena utiču na dva terete aminokiseline koje utječu na klirens plazme proteina i kolesterola bogatih lipoproteina nosi ovaj protein. (. Slika 1), kao posljedica, postoji povezanost alela podataka sa nivoom plazma lipida (E2 alel smanjuje njihovu koncentraciju i E4 - povećava), to dovodi do toga da je nekoliko alela E2 smanjuje rizik od srčanih bolesti i značajno povećava E4.

Meta-analiza efekata ApoE genotipa na lipide plazme i rizik od razvoja srčanih bolesti. Za svaku studiju, kontrolna grupa sastojala se od nepušača sa HCV genotipom 3 3. Promjena (uz dozvolu): Bennet prije podne, Di Angelantonio E., Zheng Y. et al. Udruženje apolipoproteina E genotipova nivo lipida i koronarne rizik // JAMA. - 2007. - N. 298. - P. 1300-1311.

Sl. 1. Meta-analiza efekta ApoE genotipa na lipide plazme i rizik od razvoja srčanih bolesti. Za svaku studiju, kontrolna grupa sastojala se od nepušača sa HCV genotipom 3 mar.

Modificirani (uz dozvolu): Bennet prije podne, Di Angelantonio E., Zheng Y. et al. Udruženje apolipoproteina E genotipova nivo lipida i koronarne rizik // JAMA. - 2007. - N. 298. - P. 1300-1311.

Silvia G. Priori, Karlo Napolitano, Steve E. Humphries i James Skipworth

Genetski aspekti kardiovaskularne bolesti

Udio u društvenim mrežama:

Povezani