Kao i neke neobične RNK molekule pogodi metu

Geni koji kodiraju proteine - ukupno više od 20 hiljada - i čine samo oko 1% od ukupnog ljudskog genoma.

Čitav "sistem" u cjelini - ne samo geni, ali i genetska smeće, a sve ostalo - je rana i formirana na brojne načine oko jezgru svake ćelije.

Samo mislim o poteškoćama s kojima se suočavaju proteina i drugih molekula, kao što je RNA, kada se među svim ove sorte su u potrazi za određeni gen.

Grupa istraživača na čelu biolog Mitchell Gutman (Mitchell Guttman) iz California Institute of Technology (Caltech) i Kathrin Plath (Kathrin Plath) iz University of California su otkrili kako su neki RNK molekule iskoristio svoj položaj u trodimenzionalnom mješavina genomske materijala za postizanje ciljeva koji su im potrebni. Studija je objavljena u najnovijem broju časopisa Science Express.

Rezultati pokazuju jedinstvenu ulogu za RNK klasu zvanu lncRNA, koji Gutmann i njegove kolege na Massachusetts Institute of Technology i Sveučilište Harvard je prvi put opisana 2009. godine. Do tada, ovi lncRNA (dugo nije kodirana RNK) često ignorišu jer su između gena koji kodiraju proteine. Gutman i njegove kolege su pokazali da lncRNA podrška se kombiniraju i organizirati ključne proteine uključene u pakiranje genetske informacije za gensku regulaciju ekspresije kroz kontrolu, na primjer, sudbina ćelija u određenim matičnih ćelija.

U novom radu, istraživači su otkrili da lncRNA lako možete pronaći i komunicirati sa susjednim genima. Zatim, preko proteina koji preurediti genetskog materijala molekula može uključiti dodatne povezanih gena i da se preseli u nova područja, izgradnja "odvajanje", u kojem mnoštvo gena može biti pod kontrolom istovremeno.

"Sada možete misliti o tim lncRNA kao način da se kombinuju gene koji su potrebni za obavljanje određene funkcije u jednom fizičkom području, a zatim podesite ih kao skup, a ne pojedinačno", kaže Gutman. "Oni nisu samo rekvizite proteina, ali i organizatori aktivnost gena."

Novi rad je fokusiran na lncRNA molekula koji se zove Xist. To je Odavno je poznato da se uključe u putovanje jedan od dva X kromosoma kod žena sisara (to se događa sa gen normalno mogao funkcionirati). Vrlo malo znalo o tome kako Xist postiže ubijanje. Poznato je, na primjer, da je molekula veže za X-kromosoma, koristi regulator kromatina da pomogne u organizaciji i mijenjati hromatina strukturu, i da su neke odabrane područja RNK učiniti sve ovaj posao moguće. Uprkos tome znanja, na molekularnom nivou, nije bilo jasno kako Xist zapravo pronalazi svoju svrhu i distribuira se u X-kromosoma.

Da bismo razumjeli ovaj proces, Gutmann i njegove kolege su razvili tehniku koja se zove RNK Antisense Detoksikacija (RAP). U svojoj prijavi, i sekvenciranja DNK, visoke rezolucije, oni su mogli da vide gdje je poslan na različite lncRNA. Zatim, rad sa haljine Group u Los Angelesu, oni su koristili svoje metode za praćenje u visokoj rezoluciji koja su Xist molekule aktiviraju u nediferencirane matične ćelije miševa i proces ubijanja X-kromosoma nastavlja.

"Ovo je mjesto gdje je tu najzanimljivija. RNK ne "gura nos" oko, pokušava da pronađe svoj cilj i ciljano. Bilo je jasno da je ovo RNK zapravo koristi informacije o njihovom položaju u prostoru da su ciljevi koji su vrlo daleko od svoje pozicije unutar genoma, ali je blizu RNK u trodimenzionalnom prostoru. "

Prije nego što Xist uskoro geni X hromozoma distribuira svoja odredišta. Ali istraživači su otkrili da čim je omogućeno Xist, brzo privlači gene, formirajući oblak. "I to ne samo da je nivo izražavanja Xist postaju sve više i više", kaže Gutman. «Xist povezuje sve u vezi gena u nuklearnoj strukturi, onda su svi zauzimaju isti teritoriju."

Doktori su otkrili da određeni region Xist, poznat kao A-ponavljanje domena (A-ponavljanje domena) i važan je za sposobnost da biste isključili lncRNA gena X kromosoma, također je potrebno uključiti sve zaglavljen gena. Kada su istraživači ukloniti domenu X kromosom nije postao nije aktiviran, jer nije formirana komore prigušivanje.

Jedan od najzanimljivijih aspekata novog studija, u skladu sa Gutmann je posljedice koje prevazilaze jednostavno objašnjenje mehanizma radi Xist molekula. "U našem radu, mnogo smo razgovarali o od Xist, ali rezultati će vjerovatno biti na raspolaganju za ostale lncRNA».

On je dodao da je rad jedan od prvih pružiti informacije da objasni ono što čini lncRNA poseban. «LncRNA, za razliku od proteina, mogla bi, u stvari, koristi svoje genomske informacije - njegov sadržaj i lokaciju - da djeluju, da kombinuju svrhu. To ih čini prilično jedinstven. "

Udio u društvenim mrežama:

Povezani